การศึกษาประสิทธิภาพของการตรวจหาสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 แบบขั้นตอนเดียว เปรียบเทียบกับการตรวจหาสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 แบบ Real time RT-PCR
Main Article Content
บทคัดย่อ
ชุดตรวจ cobas® SARS-CoV-2 มีกระบวนการสกัดสารพันธุกรรม และการเพิ่มปริมาณของสารพันธุกรรมรวมถึงการตรวจวัดสัญญาณของ fluorescent ของตัวตรวจจับ (TaqMan Probe) ด้วยวิธี Multiplex Real-time RT-PCR ในเครื่องเดียวกัน โดยยีนเป้าหมายคือบริเวณตำแหน่ง Open Reading Frame (ORF 1a/b) และ Nucleocapsid Protein (N) Gene ระยะเวลาที่ใช้ในการตรวจและรายงานผล ประมาณ 20 นาที ความไวของการตรวจวิเคราะห์เชื้อ SARS-CoV-2 (Sensitivity): 0.012 TCID50/mL or 12 copies/ml การวิจัยนี้เป็นการศึกษาเชิงวิเคราะห์ ใช้ในการประเมินประสิทธิภาพ ความไว ความจำเพาะ และความถูกต้อง ของการตรวจวิเคราะห์หาสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 ด้วยวิธี Real time RT-PCR แบบขั้นตอนเดียว เปรียบเทียบกับวิธี Real time RT-PCR ปกติ ในกลุ่มตัวอย่าง 60 ตัวอย่าง แบ่งเป็นตัวอย่างที่พบสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 จำนวน 30 ตัวอย่าง และตัวอย่างที่ไม่พบสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 จำนวน 30 ตัวอย่าง พบว่า วิธี Real time RT-PCR แบบขั้นตอนเดียว ให้ผลตรงกับวิธีมาตรฐาน คิดเป็นความไว (sensitivity) 100% และความจำเพาะ (specificity) 100% ที่ค่าระดับความเชื่อมั่น 95% มีช่วงค่าความเชื่อมั่น (confident interval) อยู่ที่ 88.40% - 100% การตรวจยืนยันผู้ติดเชื้ออย่างรวดเร็ว จะช่วยผู้ป่วยให้ได้รับการรักษา ทั้งยังสามารถสนับสนุนภารกิจทางทหารเมื่อได้รับการร้องขอ เครื่องมือการตรวจยืนยันผลการวินิฉัยในขั้นตอนเดียว สามารถลดระยะเวลา และต้นทุนในการตรวจ ผลลัพธ์ที่ได้จะสามารถนำมาเป็นแนวทางในการปฏิบัติงานทางห้องปฏิบัติการ อันจะเป็นประโยชน์ในการสนับสนุนงานทางด้านการบริการทางการแพทย์แก่กองทัพบก ลดความสูญเสียอันมีเหตุจากการติดเชื้อโรคโควิด 19 และควบคุมการแพร่ระบาดของโรคต่อไป
Article Details
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
References
Wapute N, Kanjanapoom K, Tansakul K. Preventive behaviors against the coronavirus-2019 among students at Songkhla Rajabhat University. Journal of Council of Community Public Health. 2021;2:31–9.
Kamsan N. Knowledge, attitudes, and behaviors regarding self-protection against COVID-19 infection among the people in U-Thong District, Suphan Buri Province. ๋Journal of Prachomklao Collage of Nursing, Phetchaburi Province. 2021;4(1):33–48.
Poovorawan ProfY. Knowledge about viruses 1.4 Naming of coronaviruses and naming of diseases. [Internet]. 2022 [cited 2022 Sep 27]. Available from: https://learningcovid.ku.ac.th/course/?c=1&l=4
World Health Organization. WHO Coronavirus (COVID-19) Dashboard.2565 [Internet]. World Health Organization. 2022 [cited 2022 Sep 27]. Available from: https://covid19.who.int/
Tantipassawasin S. COVID-19, the pandemic that disrupted the world. Chonburi Hospital Journal. 2021;45(1):1–3.
Rattanarotpong T, Peudpan W, Subsuttipat S, Autjawattanawong P. New coronavirus strain (COVID-19): Knowledge in virology research, diagnostic data studies, treatment, and vaccine development [Internet]. Thailand Health Systems Research (Knowledge Bank: KB). 2021 [cited 2022 Sep 27]. Available from: https://kb.hsri.or.th/dspace/handle/11228/5350?locale-attribute=th
Itsarasongkram M. A study on the sensitivity, specificity, and accuracy of using Antigen Test Kits compared to the detection of the genetic material of the coronavirus 2019 through Real-time RT-PCR at points of service for screening the coronavirus 2019 in the field. Journal of The Office of ODPC 7 Khon Kaen. 2022;29(1):91–100.
McIntyre W, Netzband R, Bonenfant G, Biegel JM, Miller C, Fuchs G, Henderson E, Arra M, Canki M, Fabris D, Pager CT. Positive-sense RNA viruses reveal the complexity and dynamics of the cellular and viral epitranscriptomes during infection. Nucleic Acids Res. 2018 Jun 20;46(11):5776-5791. doi: 10.1093/nar/gky029. PMID: 29373715; PMCID: PMC6009648.
Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature. 2020 Feb 3;579:270–3.
Cui J, Li F, Shi ZL. Origin and evolution of pathogenic coronaviruses. Nature Reviews Microbiology. 2018 Dec 10;17:181–92.
X L, Luk H, Lau S, Woo P. Human Coronaviruses: General Features. 2019 Jan 1;
Wu F, Zhao S, Yu B, Chen YM, Wang W, Hu Y, et al. Complete genome characterisation of a novel coronavirus associated with severe human respiratory disease in Wuhan, China. bioRxiv The Preprint server for biology. 2020 Feb 2.
World Health Organization. Coronavirus [Internet]. 2020. Available from: https://www.who.int/health-topics/coronavirus#tab=tab_3
World Health Organization. Laboratory testing for coronavirus disease 2019 (COVID-19) in suspected human cases: Intern guidance. 2020. [08 November 2022]. https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/331329/WHO-COVID-19-laboratory-2020.4-eng.pdf?sequence=1&isAllowed=y
World Health Organization. Coronavirus disease (COVID-19) technical guidance: Laboratory testing for 2019-nCoV in humans. 2565 [08 November 2022]. http://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/laboratory-guidance
Ritchie H, Mathieu E, Rodés-Guirao L, Appel C, Giattino C, Ortiz-Ospina E, et al. Coronavirus pandemic (COVID-19). Our World Data. 2020. Available on: https://ourworldindata.org/coronavirus-testing.
World Health Organization. WHO IN HOUSE ASSAYS [Internet]. 2565 [08 November 2022]. Available on: https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/whoinhouseassays.pdf.
Department of Medical Sciences. Diagnosis of Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). 2019; Available from: Diagnosis of Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)
Department of Medical Sciences. Guidelines for managing the laboratory testing system and reporting results for COVID-19 using a single laboratory system. 2020; Available from: Guidelines for managing the laboratory testing system and reporting results for COVID-19 using a single laboratory system.
Medical Device Control Division. Medical - test_kit_covid19 [Internet]. www.fda.moph.go.th. Available from: https://www.fda.moph.go.th/sites/Medical/SitePages/test_kit_covid19.aspx